えー、忙しかったり、精神的にまいってしまったり、サーバーのHDDが年数たってやばいので、交換+RAID化してたりでいろいろ作業が発生して、ツールのアップデートすらままならない状態なのですが・・・
GeForce 275.xx以降、ドライバのプロファイル仕様が変更されたのかなにかで、PSUOBBAAToolがうまく動作しない場合があります。
原因は、仕様変更でドライバ更新時にプロファイルのアプリケーション名が削除されてしまうためです。
回避策もあるので、なんとかしたいところですが、アップデートは月曜以降になりそうです。
とりあえずの回避方法ですが、ドライバを更新(同じバージョンだとだめなのです><)した際に、ドライバの詳細オプションでクリーンインストールを選択、その後、PSUOBBAAToolを起動すると、プロファイルの引き継ぎ画面が表示されますが、その際に引き継ぎをしない(チェックを外して)でください。
その後、PSUOBBAAToolで再設定することで、またPSUにアンチエイリアスがかかります。

とりあえず、新規インストール時には、280.19ベータでも、アンチエイリアスはかけることができることは、上記の画像を見てもらえばわかりますが、確認しております。
8/1追記
GeForce Release 275.33ドライバをインストールした時点でプロファイルのアプリケーション名がなくなってしまうことを確認しました。また、GeForce Release 280.19 Betaでは、アプリケーション名が残っていることを確認しています。
但し、GeForce 275.33(50もかも?)を一度でも適用していると、プロファイルが不正になります。
PSUOBBAATool 1.6.49では、プロファイル保存時に、アプリケーション名を正しく保存するように修正しております。(アップデータにて公開)